43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0251 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0251  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 		 85 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.129721  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  75 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2286  Exonuclease VII small subunit  70.67 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.620752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  64.29 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2079  Exonuclease VII small subunit  60 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  47.56 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  53.25 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.03 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.74 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  44.9 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.71 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.79 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.6 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.96 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.74 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.59 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.34 
 
 		 76 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0314  Exonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 86 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.311113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  24.56 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  26.32 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  26.32 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.75 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  26.32 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.86 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.2 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.94 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.78 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.65 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.27 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  29.69 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.69 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.14 
 
 		 83 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>