263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0249 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
76 aa  146  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  86.84 
 
 
77 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.97 
 
 
76 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.52 
 
 
76 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.52 
 
 
76 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.37 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.48 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.67 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.33 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.67 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.28 
 
 
70 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.18 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.58 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.53 
 
 
80 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.53 
 
 
80 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.71 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1669  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000880334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.71 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.65 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.44 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.43 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.15 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  40.54 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1183  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.52 
 
 
71 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
76 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.73 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.72 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.06 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.06 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.08 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.14 
 
 
80 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.06 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.89 
 
 
79 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.44 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.32 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.9 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.8 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  37.31 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.29 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.46 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.8 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.25 
 
 
82 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.14 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.23 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.33 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0497  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.97 
 
 
71 aa  53.5  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
81 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
83 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0923  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00562605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.33 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.39 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.03 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>