220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2781 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
80 aa  153  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.25 
 
 
84 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.84 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.48 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.67 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  51.61 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.33 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.57 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1669  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.05 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000880334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.77 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.28 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.03 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.62 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.85 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.82 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.97 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.46 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.46 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.7 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.59 
 
 
85 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.31 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0234  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.733912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  37.33 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 
88 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 
88 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.51 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.25 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.47 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.03 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.71 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1745  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.07 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.71 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1036  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.07 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
85 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.37 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 
83 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.33 
 
 
85 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
82 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 
155 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.29 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  40.3 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.76 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2013  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322776  hitchhiker  0.00272964 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 
94 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0472  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.59 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.62 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>