74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0472 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0472  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3116  Exonuclease VII small subunit  45.71 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0118583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0269  Exonuclease VII small subunit  49.25 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4569  Exonuclease VII small subunit  43.94 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0263  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.46 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.18 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.82 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0234  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.33 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.733912  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.85 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.88 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.82 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.82 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2240  exonuclease VII small subunit  39.71 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754101  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.25 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28.57 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.85 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.92 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.26 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.14 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1745  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.92 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.73 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.08 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 		 86 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.73 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2013  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.07 
 
 		 117 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322776  hitchhiker  0.00272964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  38.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.03 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1036  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.51 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.38 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1154  Exonuclease VII small subunit  31.25 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.38 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.07 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1222  Exonuclease VII small subunit  31.25 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.35 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.25 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.91 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.94 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1236  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.19 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.3 
 
 		 77 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1094  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.03 
 
 		 93 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0363068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>