127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0745 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.43 
 
 
92 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.38 
 
 
76 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.32 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.93 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.9 
 
 
86 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.94 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.08 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.46 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  62.71 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.94 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.02 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  62.07 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  60.34 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  68.75 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.45 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.33 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.56 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.72 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.24 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.7 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  49.28 
 
 
97 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.14 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.17 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.62 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.62 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.62 
 
 
70 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.97 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.69 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  64 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.49 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.9 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  55.93 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.12 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.94 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.44 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.28 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.94 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.95 
 
 
85 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.67 
 
 
94 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.09 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  53.57 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
85 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.07 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.9 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.77 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.65 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.35 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  45.1 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.06 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.82 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.82 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.06 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.15 
 
 
102 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.06 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.28 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.38 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0528  Exonuclease VII small subunit  39.62 
 
 
60 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06260  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0413231  normal  0.0182875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  37.88 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.1 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  34.38 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.3 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.48 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.73 
 
 
105 aa  42  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.82 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.83 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.83 
 
 
104 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
88 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>