152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8484 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  100 
 
 		 97 aa  193  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  74.68 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  64.29 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  67.8 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  73.58 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  59.46 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.85 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.87 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  67.21 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.93 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.1 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.95 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.29 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  64.91 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  62.3 
 
 		 70 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  61.67 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.67 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  64.81 
 
 		 70 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.67 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  58.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.16 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.5 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.5 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.93 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.11 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.94 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60.71 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.23 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.23 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.23 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.28 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.61 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  59.26 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.14 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.86 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.63 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.28 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.07 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.33 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.73 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.55 
 
 		 83 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.37 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.32 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.56 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.16 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.64 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.54 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.18 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.06 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.73 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  48 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.73 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.24 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.86 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  38.81 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.1 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.1 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.14 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.21 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.59 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1055  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.17 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0417  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.62 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.25 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.15 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.94 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.23 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1663  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.73 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.34 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  48.08 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>