231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0417 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0417  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
90 aa  176  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.45 
 
 
70 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.38 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.38 
 
 
85 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  45.07 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.37 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.54 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.88 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.68 
 
 
87 aa  57.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.68 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.55 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.45 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
82 aa  57  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.33 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
82 aa  57  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.44 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.67 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.1 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0097  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.21 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.48 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2013  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.97 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322776  hitchhiker  0.00272964 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.55 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  45.61 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
76 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.88 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.21 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.64 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
77 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1984  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
87 aa  53.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.66 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0234  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.79 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.733912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.55 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2213  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190434  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
97 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
97 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
97 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.26 
 
 
86 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.12 
 
 
84 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.12 
 
 
84 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.28 
 
 
89 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.71 
 
 
84 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2240  exonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
78 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754101  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
105 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1036  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.43 
 
 
89 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.08 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1644  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.94 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.82 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1976  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.94 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.700847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.89 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2035  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.06 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.89 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
93 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.17 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.66 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.67 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.79 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.28 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1133  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.08 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44078  hitchhiker  0.0045107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
82 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
80 aa  50.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0881  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.96 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.66 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.16 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>