156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
104 aa  202  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.93 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  73.68 
 
 
77 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.65 
 
 
91 aa  84  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.81 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  68.42 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.14 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  67.74 
 
 
86 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  71.93 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  65 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  62.3 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  61.29 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.75 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.3 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  74.47 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.06 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  61.29 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  66.1 
 
 
66 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.06 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.06 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.32 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.33 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.67 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  65.45 
 
 
70 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.77 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.1 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  63.64 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  66.67 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  61.82 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  57.14 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  67.39 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.25 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.25 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.25 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.46 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.46 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
82 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.71 
 
 
87 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.73 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.61 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.73 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  46.43 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.17 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.1 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1976  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.69 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.700847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.08 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.08 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1644  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.69 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  42.86 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.83 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.24 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.9 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.24 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.24 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.91 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.23 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.68 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.81 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.23 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.97 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.97 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.82 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.94 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.86 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.48 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>