151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0877 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  100 
 
 
70 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  92.75 
 
 
70 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  79.31 
 
 
66 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  76.27 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  74.14 
 
 
77 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.38 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.24 
 
 
96 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  72.41 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  72.58 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  71.19 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  74.07 
 
 
72 aa  77  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  72.73 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  67.21 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.24 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  73.58 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  73.08 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.46 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.33 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.07 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  62.3 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  55.71 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  65.45 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  70.21 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.64 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  65.52 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.82 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.26 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.14 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.69 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.36 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.18 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.73 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.73 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.73 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.85 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.09 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.71 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.09 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.09 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.09 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.06 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.28 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.72 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.02 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  49.18 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.71 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0417  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.76 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.21 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.06 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 
84 aa  47.4  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.08 
 
 
109 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.39 
 
 
86 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.48 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  42.59 
 
 
100 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
83 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.08 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.23 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.23 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.98 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.15 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.02 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.98 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.43 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.73 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.43 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.07 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.98 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.84 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.98 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.98 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>