65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2513 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2513  exonuclease VII small subunit  100 
 
 		 71 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.77 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.89 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.68 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.87 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.09 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.94 
 
 		 75 aa  44.3  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  38.46 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  25.81 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1424  Exonuclease VII small subunit  33.96 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.506182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.12 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  36.21 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.39 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1706  exonuclease VII, small subunit  35.85 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  40.68 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.82 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34 
 
 		 88 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 80 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.57 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  26.79 
 
 		 94 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34 
 
 		 88 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.09 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.82 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.38 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.09 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  36.36 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.82 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.82 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.36 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.08 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.85 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.77 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2035  exodeoxyribonuclease VII small subunit  26.79 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.76 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.919185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>