More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0818 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0818  malate dehydrogenase  100 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1398  malate dehydrogenase  66.11 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0557  malate dehydrogenase  65.44 
 
 		 300 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0636  malate dehydrogenase  65.77 
 
 		 300 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  36.39 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0912  malate dehydrogenase  38.38 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  35.15 
 
 		 307 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  36.05 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  36.95 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2254  malate dehydrogenase  40.96 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000348768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  35.84 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.17 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  35.03 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  37.5 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  36.63 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  35.17 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.52 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  37.33 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.84 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  34.8 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.42 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  38 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  33.22 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1883  lactate/malate dehydrogenase NAD binding subunit  41.37 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  38.23 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.33 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  36 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  35.88 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  35.14 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  33.67 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  35.33 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.11 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.79 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  35.81 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  33.89 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.8 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  35.55 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  35.49 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.88 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  32.87 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.37 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.54 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  32.79 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  36 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  35.12 
 
 		 320 aa  175  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  34.83 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  35.45 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  34.46 
 
 		 312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  36.45 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  34.98 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  34.33 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1136  malate dehydrogenase  35.84 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  34.47 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.54 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  33.79 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  34.67 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  35.33 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  34.67 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  33.67 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  32.78 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  31.15 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  34.67 
 
 		 322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  34 
 
 		 322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.33 
 
 		 333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  33.78 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  33.67 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1509  malate dehydrogenase  32.39 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.195418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  34.11 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  32.34 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  34.13 
 
 		 309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.66 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.46 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  31.14 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.46 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  33.44 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.33 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  34.22 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  34.8 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  31.42 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  31.42 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2341  Lactate/malate dehydrogenase  30.48 
 
 		 390 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141396  hitchhiker  0.00418308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  35.33 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  35.33 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0615  Lactate/malate dehydrogenase  32.78 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  31.19 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  33.67 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>