More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1136 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1136  malate dehydrogenase  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0912  malate dehydrogenase  47.7 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2254  malate dehydrogenase  43.25 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000348768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1883  lactate/malate dehydrogenase NAD binding subunit  45.02 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.79 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  33.99 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  39.53 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  39.29 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.99 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.33 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  37.28 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  34.93 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  34.02 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  35.84 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  36.17 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.37 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.89 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  32.46 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  36.24 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  36.52 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  37.11 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  36.2 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1509  malate dehydrogenase  34.3 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.195418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0818  malate dehydrogenase  35.84 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  37.14 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  34.16 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0497  malate dehydrogenase (NAD)  31.06 
 
 		 432 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  35.43 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  35.62 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  34.05 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1398  malate dehydrogenase  35.81 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0557  malate dehydrogenase  35.47 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  35.64 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.03 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  36.52 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  35.44 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1571  malate dehydrogenase  33.45 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000156495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1699  malate dehydrogenase  33.57 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000446484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  35.25 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.57 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.31 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0636  malate dehydrogenase  35.02 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  36.86 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  32.9 
 
 		 318 aa  165  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  39.76 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  34.43 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.61 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  33.56 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  31.31 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  31.44 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1675  malate dehydrogenase  33.21 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0291374  normal  0.817536 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  36.57 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.16 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  37.2 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.51 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  32.28 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  33.89 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  33.11 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0687  malate dehydrogenase  33.68 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663685  normal  0.0260965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.95 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.22 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  33.22 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2341  Lactate/malate dehydrogenase  31.03 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141396  hitchhiker  0.00418308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  32.2 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  34.77 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  31.88 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  31.88 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  32.2 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  31.54 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  31.37 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  33.9 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  33.9 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  31.86 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0697  malate dehydrogenase  32.88 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.16 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.79 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.79 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.68 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  30.42 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  31.88 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  32.76 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  34.81 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.47 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  36.8 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.47 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.01 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  33.11 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  35.09 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  32.42 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>