More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0636 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0636  malate dehydrogenase  100 
 
 
300 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0557  malate dehydrogenase  99 
 
 
300 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1398  malate dehydrogenase  98 
 
 
300 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0818  malate dehydrogenase  65.77 
 
 
298 aa  417  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  37.07 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  35.37 
 
 
310 aa  209  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  36.73 
 
 
310 aa  208  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2254  malate dehydrogenase  41.98 
 
 
297 aa  207  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000348768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  36.52 
 
 
308 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  36.39 
 
 
310 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0912  malate dehydrogenase  36.03 
 
 
306 aa  202  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  33.67 
 
 
310 aa  199  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  36.05 
 
 
310 aa  193  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.76 
 
 
316 aa  192  7e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  35.03 
 
 
308 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.9 
 
 
311 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  35.93 
 
 
308 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  34.33 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.84 
 
 
312 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  35.23 
 
 
324 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.16 
 
 
309 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.15 
 
 
326 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  35.49 
 
 
314 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.47 
 
 
308 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  35.03 
 
 
310 aa  185  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  33.56 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  34.33 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  32.78 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  32.78 
 
 
313 aa  180  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1883  lactate/malate dehydrogenase NAD binding subunit  39.93 
 
 
297 aa  180  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  32.42 
 
 
309 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.23 
 
 
315 aa  179  4e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  32.42 
 
 
309 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.47 
 
 
320 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  31.63 
 
 
309 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  32.77 
 
 
312 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  35.15 
 
 
307 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  33.78 
 
 
312 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  33.45 
 
 
312 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  33.33 
 
 
332 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  34.11 
 
 
321 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.4 
 
 
307 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  31.77 
 
 
321 aa  175  7e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  32.01 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  34.45 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.22 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  32.44 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  31.97 
 
 
312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  32.09 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  32.67 
 
 
318 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  32.2 
 
 
311 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  33.99 
 
 
317 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  31.77 
 
 
320 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.22 
 
 
312 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  33.33 
 
 
319 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  33.88 
 
 
318 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  31.77 
 
 
320 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  34.54 
 
 
317 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1509  malate dehydrogenase  31.51 
 
 
308 aa  170  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.195418  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1136  malate dehydrogenase  35.47 
 
 
297 aa  169  5e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.97 
 
 
310 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  34.32 
 
 
317 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1699  malate dehydrogenase  31.51 
 
 
309 aa  169  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000446484 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  34.3 
 
 
332 aa  168  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  31.44 
 
 
320 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  31.77 
 
 
320 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  33.99 
 
 
317 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  31.44 
 
 
320 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.79 
 
 
320 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.79 
 
 
320 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  31.44 
 
 
321 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  31.1 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  33.11 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.11 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.77 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  33.78 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.1 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  32.12 
 
 
316 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  33.11 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  30.14 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  33.11 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  30.43 
 
 
320 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  31.79 
 
 
316 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.33 
 
 
320 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1974  Lactate/malate dehydrogenase  35.46 
 
 
304 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  31.79 
 
 
316 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  31.35 
 
 
322 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  31.79 
 
 
316 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  30.51 
 
 
313 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  32.43 
 
 
312 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  31.02 
 
 
322 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>