182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13810 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13810  Sel1 repeat protein  100 
 
 
295 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28 
 
 
684 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0772  hypothetical protein  73.81 
 
 
62 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287001  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.79 
 
 
1493 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 
464 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.89 
 
 
961 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.65 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.69 
 
 
831 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.05 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.3 
 
 
373 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  28.64 
 
 
1078 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  28.64 
 
 
1044 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.34 
 
 
1402 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.71 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  35.78 
 
 
117 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.33 
 
 
789 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  39.81 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.86 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.14 
 
 
1002 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.68 
 
 
528 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.04 
 
 
359 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
976 aa  58.9  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.69 
 
 
1037 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.57 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.14 
 
 
425 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.28 
 
 
552 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  30.43 
 
 
765 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
705 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.71 
 
 
523 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  36.94 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.81 
 
 
490 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.58 
 
 
838 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.13 
 
 
208 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.81 
 
 
490 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26710  Sel1 repeat protein  28.31 
 
 
199 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  33.02 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.75 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  34.21 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.71 
 
 
489 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.81 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
448 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
1032 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.62 
 
 
997 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25.81 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 
487 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  30.72 
 
 
212 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  33.9 
 
 
1910 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  26.43 
 
 
913 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  29.37 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.2 
 
 
1877 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30.33 
 
 
255 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
1430 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.41 
 
 
225 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  27.45 
 
 
235 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  27.05 
 
 
731 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.26 
 
 
341 aa  52.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0106  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
454 aa  52.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.41 
 
 
231 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.57 
 
 
393 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.65 
 
 
798 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.56 
 
 
241 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30 
 
 
264 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.27 
 
 
693 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.51 
 
 
2413 aa  52.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.26 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  27.42 
 
 
985 aa  51.6  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 
557 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  30.33 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.25 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  31.63 
 
 
971 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
865 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  28.81 
 
 
1281 aa  50.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.63 
 
 
971 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.31 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33 
 
 
346 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  26.7 
 
 
978 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.48 
 
 
211 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
181 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  32.41 
 
 
202 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.03 
 
 
376 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  33.04 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  29.91 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  32.26 
 
 
327 aa  49.7  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.13 
 
 
282 aa  49.3  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  29.41 
 
 
482 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.1 
 
 
1260 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.1 
 
 
1263 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  27.27 
 
 
209 aa  49.3  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  29.37 
 
 
763 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.83 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.02 
 
 
679 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  33.67 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
842 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  35.45 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.91 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>