More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0198 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0198  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 149 aa  301  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0226564  normal  0.736075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0197  biopolymer transport protein ExbD/TolR  65.1 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.058797  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.34 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  45.83 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  43.06 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  43.06 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  45.83 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  44.44 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  44.83 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  44.83 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  40.14 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  44.14 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  44.19 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  40.28 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  42.36 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  44.14 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  40.28 
 
 		 169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  41.5 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  41.67 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.54 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  42.07 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.09 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.56 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0748  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.65 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  38.64 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  38.64 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  38.64 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  43.08 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  38.64 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.31 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  44.53 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  37.88 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  39.53 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  41.86 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  41.86 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  40.15 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  41.86 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.06 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.06 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.98 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  38.76 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  37.12 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  40.54 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0726  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 187 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  37.31 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  40.77 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  35.77 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1132  TonB system transport protein ExbD  41.6 
 
 		 157 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0300188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  37.41 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0921  biopolymer transport protein, ExbD  41.73 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284427  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.68 
 
 		 150 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  38.89 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1268  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.62 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0930334  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2306  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.62 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426715  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.62 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  38.19 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.41 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1516  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.62 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.890263  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  39.06 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3966  TonB system transport protein ExbD  36.81 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.57 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  40.62 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1667  TonB system transport protein ExbD  38.89 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1613  TonB system transport protein ExbD  38.89 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3332  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156003  normal  0.605878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.1 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.12 
 
 		 137 aa  87.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  39.84 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  36.72 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  39.06 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  38.17 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  39.84 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0174  TonB system transport protein ExbD  32.64 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  34.38 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  37.88 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  36.22 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  36.22 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6883  putative TolR protein  38.58 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604254  normal  0.0755944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  35.43 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.11 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>