More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3110 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3110  aminotransferase class I and II  100 
 
 
381 aa  761    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1560  aminotransferase, class I and II  61.52 
 
 
385 aa  455  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0117  aminotransferase class I and II  59.04 
 
 
377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00105897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3411  aminotransferase class I and II  58.64 
 
 
388 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193899  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2288  aminotransferase  32.38 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3410  aminotransferase class I and II  39.47 
 
 
392 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190651  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0374  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 
411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0819  aminotransferase, class I/II  29.59 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0061  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.61 
 
 
421 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  28.74 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  28.65 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  28.81 
 
 
400 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  28.65 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  27.67 
 
 
404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 
404 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 
404 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 
404 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 
404 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  31.07 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 
404 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 
405 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.32 
 
 
543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.42 
 
 
403 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  29.66 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  27.06 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  28.24 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  29.03 
 
 
404 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  28.37 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  29.03 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  29.03 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.9 
 
 
505 aa  123  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  26.8 
 
 
404 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  27.59 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  29.71 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  26.72 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  29.24 
 
 
404 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  26.89 
 
 
508 aa  119  9e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  27.59 
 
 
409 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  25.36 
 
 
404 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.61 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  26.36 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  26.8 
 
 
423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  27.14 
 
 
411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.6 
 
 
518 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  28.21 
 
 
429 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  28.21 
 
 
429 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 
404 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  24.14 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  25.88 
 
 
404 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  26.57 
 
 
412 aa  116  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  27.71 
 
 
414 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  26.8 
 
 
409 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  28.35 
 
 
403 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.93 
 
 
545 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  27.51 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  25.71 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  26.46 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  26.18 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  25.92 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.09 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  25 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  26.22 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  27.43 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  27.59 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  26.18 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  27.59 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  26.18 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  25.92 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  26.18 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  26.88 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  26.4 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  26.17 
 
 
403 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.43 
 
 
546 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  26.33 
 
 
403 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  26.91 
 
 
429 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  25.95 
 
 
411 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  25.63 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  26.02 
 
 
403 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  26.06 
 
 
404 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  26.44 
 
 
406 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  26.65 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  27.5 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  25.63 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.25 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 
403 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  29.28 
 
 
432 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  27.09 
 
 
427 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  27.19 
 
 
409 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  26.22 
 
 
418 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  26.38 
 
 
416 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>