More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3410 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3410  aminotransferase class I and II  100 
 
 
392 aa  751    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190651  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2288  aminotransferase  41.47 
 
 
390 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0374  aminotransferase class I and II  45.75 
 
 
411 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0061  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.68 
 
 
421 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1560  aminotransferase, class I and II  41.36 
 
 
385 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3411  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 
388 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193899  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0819  aminotransferase, class I/II  34.07 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3110  aminotransferase class I and II  39.47 
 
 
381 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0117  aminotransferase class I and II  37.83 
 
 
377 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00105897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  32.08 
 
 
404 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  30.69 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  30.03 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  28.98 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  28.76 
 
 
405 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  26.06 
 
 
404 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  31.63 
 
 
432 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  27.45 
 
 
412 aa  124  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  29.65 
 
 
403 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  29.65 
 
 
403 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  26.03 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  28.38 
 
 
403 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  29.38 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.27 
 
 
545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  29.92 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.54 
 
 
415 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  27.36 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  26.63 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  23.75 
 
 
546 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  26.61 
 
 
423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  29.11 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  27.91 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  27.93 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  26.2 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  27.93 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  28.92 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  27.93 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  27.93 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  27.37 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  27.37 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 
404 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  28.12 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  27.24 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  29.23 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  30.21 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.54 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  28 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  27.61 
 
 
410 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  26.95 
 
 
403 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  28.03 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  28.73 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  28.88 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  26.79 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  28.03 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  28.03 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.91 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  26.9 
 
 
404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  28.18 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  29.38 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  26.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  26.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  26.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  26.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  26.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  26.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  26.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  26.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  28.03 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  25.53 
 
 
404 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  27.38 
 
 
404 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  26.29 
 
 
404 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  27.08 
 
 
404 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  27.08 
 
 
404 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  27.61 
 
 
404 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  26.15 
 
 
414 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  27.61 
 
 
404 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  26.39 
 
 
405 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  25.79 
 
 
406 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  23.71 
 
 
411 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  26.65 
 
 
403 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  24.18 
 
 
404 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  28.93 
 
 
440 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  28.26 
 
 
428 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  28.26 
 
 
428 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  28.26 
 
 
428 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  26.14 
 
 
418 aa  106  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27 
 
 
404 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  26.4 
 
 
404 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  26.77 
 
 
404 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  27.24 
 
 
404 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  27.24 
 
 
404 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  27.24 
 
 
404 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  26.93 
 
 
404 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  26.93 
 
 
404 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.43 
 
 
387 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  24.69 
 
 
508 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.26 
 
 
518 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  25.61 
 
 
409 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  24.66 
 
 
404 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  26.97 
 
 
409 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 
404 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>