More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0819 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0819  aminotransferase, class I/II  100 
 
 		 395 aa  808    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0061  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  58.37 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2288  aminotransferase  36.83 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3410  aminotransferase class I and II  34.07 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190651  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0374  aminotransferase class I and II  34.5 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0117  aminotransferase class I and II  32.73 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00105897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3110  aminotransferase class I and II  29.59 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1560  aminotransferase, class I and II  28.94 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3411  aminotransferase class I and II  27.96 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  24.74 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  25.07 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  24.62 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  25.07 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  24.55 
 
 		 412 aa  96.3  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  26.1 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  22.51 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25.58 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  26.6 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  25.33 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  25.39 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51609  predicted protein  25 
 
 		 529 aa  89.7  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  22.34 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  27.24 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  22.34 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  22.31 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  23.19 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  23.66 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  23.66 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  25.13 
 
 		 508 aa  87.8  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  22.31 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  22.34 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  23.62 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  25 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  24.77 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  27.42 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  25.94 
 
 		 403 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  21.83 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  24.17 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  23.66 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  24.68 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  25.19 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  30.91 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  24.93 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  23.41 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  23.66 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  23.76 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  27.64 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  24.81 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  24.55 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  24.75 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  23.76 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  24.54 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  25.58 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  23.76 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.29 
 
 		 545 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  23.76 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  21.01 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  26.77 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  24.44 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  26.39 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  24.4 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  23.25 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  22.34 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  24.25 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  27.72 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  23.48 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  24.54 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  26.1 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  23.16 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  26.2 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  25.29 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  28.17 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  25.56 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  21.46 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.47 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  21.46 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  21.46 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  21.46 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  21.86 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  25.1 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  24.34 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.12 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  23.45 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30612  predicted protein  31.29 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  21.96 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  24.06 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  22.99 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1498  aminotransferase AlaT  25.82 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.952711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  22.77 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70108  alanine transaminase (ALAM)  32.32 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.301936  normal  0.20244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  22.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  22.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  22.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  22.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  22.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  22.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  22.67 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  22.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  22.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  23.74 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>