More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2288 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2288  aminotransferase  100 
 
 		 390 aa  810    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3410  aminotransferase class I and II  41.47 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190651  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0374  aminotransferase class I and II  41.16 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0061  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  40.26 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0819  aminotransferase, class I/II  36.83 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3411  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3110  aminotransferase class I and II  32.38 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1560  aminotransferase, class I and II  34.34 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0117  aminotransferase class I and II  31.76 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00105897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.95 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  30.36 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  27.95 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  27.62 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  28.38 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27.2 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  26.91 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  27.59 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  27.08 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  27.25 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  26.98 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.3 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  26.98 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  26.98 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  31.43 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  31.07 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  26.98 
 
 		 404 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  30.47 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  26.76 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  30.71 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27 
 
 		 377 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  31.07 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  31.07 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  29.56 
 
 		 410 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  31.07 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  26.96 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  26.49 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  25.27 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  28.18 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  26.43 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  26.49 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  27.03 
 
 		 404 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  26.75 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  26.36 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  28.66 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  29 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  29 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  29 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  29 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  29.67 
 
 		 543 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  26.18 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  27.99 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  27.45 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  26.87 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  25.71 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  29.29 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  29.29 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  28.89 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  24.71 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  29.29 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  28.89 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  28.22 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  29.29 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.88 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  26.1 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  23.58 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  27.01 
 
 		 409 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  24.29 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  23.71 
 
 		 508 aa  125  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  25.94 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  27.27 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  26.82 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  26.13 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  26.26 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  25.32 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  27.89 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  27.89 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  28.1 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>