More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0374 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0374  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 411 aa  793    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2288  aminotransferase  40.11 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3410  aminotransferase class I and II  46.61 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190651  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0117  aminotransferase class I and II  38.05 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00105897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1560  aminotransferase, class I and II  38.24 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3411  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3110  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0819  aminotransferase, class I/II  34.8 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0061  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  33.78 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  28.57 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  28.32 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  28.91 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  28.8 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.08 
 
 		 403 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  28.8 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  27.91 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  29.6 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.57 
 
 		 505 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  28.16 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  26.05 
 
 		 508 aa  94.7  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  24.34 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  27.27 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  29.8 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  26.76 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  27.82 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  27.01 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  28.77 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  27.63 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.94 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.56 
 
 		 534 aa  86.3  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  27.56 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  27.06 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  27.38 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  30.8 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.03 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  24.16 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  28.03 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  27.99 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  31.11 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.13 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  31.56 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  27.82 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  27.92 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  27.92 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  27.92 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  27.65 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  25.57 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  27.22 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.08 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  25.08 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  25.08 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  27.48 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  26.5 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  27.76 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  27.79 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  26.5 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  23.68 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  26.5 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  26.5 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  23.62 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  27.48 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  26.5 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  26.5 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  24.21 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  27.33 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  27.33 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.03 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  27.68 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  23.81 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  27.68 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  25.87 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  27.92 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  27.68 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  27.68 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  27.16 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  26.8 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  26.6 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.08 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  25.06 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  28.76 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  26.49 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  26.49 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  26.25 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.4 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  27.68 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  27.68 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  27.68 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  25.94 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  26.89 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  27.68 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  27.68 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>