More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1560 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3411  aminotransferase class I and II  86.32 
 
 		 388 aa  683    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1560  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 385 aa  781    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3110  aminotransferase class I and II  61.52 
 
 		 381 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0117  aminotransferase class I and II  55.2 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00105897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3410  aminotransferase class I and II  41.36 
 
 		 392 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190651  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2288  aminotransferase  34.34 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0374  aminotransferase class I and II  38.07 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0819  aminotransferase, class I/II  28.94 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0061  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.93 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  27.91 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  29.79 
 
 		 410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  28.21 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  28 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.28 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  28.18 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  28.18 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  28.18 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  28.53 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  27.47 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  26.72 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  27.61 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  27.47 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  27.47 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  27.47 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  29.29 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  27.47 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  28.11 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  28.78 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  28.21 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  28.57 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  26.93 
 
 		 404 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  26.02 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  28.08 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.34 
 
 		 545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  28.32 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.35 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  26.96 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  26.92 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  26.42 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  27.57 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  25.82 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  26.4 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  26.36 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  27.64 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  27.75 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.37 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.07 
 
 		 546 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  27.76 
 
 		 422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.14 
 
 		 543 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  26.65 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  26.46 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  24.93 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  27.06 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  24.11 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  28.11 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  28.62 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  27.93 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  27.17 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  27.04 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  27.85 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  25 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  27.3 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  26.22 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  25.94 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  26.37 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  27.51 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  26.22 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  26.71 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  26.61 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  26.5 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  27.61 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  27.61 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51609  predicted protein  26.27 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  26.04 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  26.14 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  26.75 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  26.38 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  26.07 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.15 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>