More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70108 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_70108  alanine transaminase (ALAM)  100 
 
 		 509 aa  1052    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.301936  normal  0.20244 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01923  alanine transaminase (Eurofung)  48.73 
 
 		 555 aa  489  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0148319 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01490  transaminase, putative  46.72 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34010  predicted protein  41.8 
 
 		 475 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333756  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30612  predicted protein  40.99 
 
 		 473 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2006  aminotransferase class I and II  41.12 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.37575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  30.33 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  28.73 
 
 		 411 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  31.06 
 
 		 415 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  30.81 
 
 		 412 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  30.81 
 
 		 412 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  28.96 
 
 		 412 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  27.95 
 
 		 418 aa  150  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  27.54 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  31.67 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1876  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0021  aminotransferase, classes I and II  31.12 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  27.83 
 
 		 409 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  27.37 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  30.9 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  32.59 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  28.22 
 
 		 413 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  27.98 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  28.7 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  28.32 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  28.22 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  26.92 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  29.25 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  28.61 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  28.57 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  29.33 
 
 		 404 aa  140  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  28.04 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  29.43 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  28.97 
 
 		 407 aa  139  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  26.89 
 
 		 414 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  29.4 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  25.28 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.12 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  28.33 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  28.39 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1793  aminotransferase AlaT  29.25 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.85 
 
 		 543 aa  134  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0444  aminotransferase class I and II  29.7 
 
 		 295 aa  133  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.312987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.34 
 
 		 545 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  26.22 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  24.74 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1879  aminotransferase AlaT  29 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123534  hitchhiker  0.0000142896 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6224  aminotransferase AlaT  28.79 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1855  aminotransferase AlaT  28.79 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 426 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  26.22 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  25.74 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  28.91 
 
 		 400 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  24.74 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  25.23 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.75 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  26.21 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  26.21 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  25.23 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  27.25 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 		 404 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  27.62 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  28.42 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  26.8 
 
 		 404 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  25.88 
 
 		 411 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  26.13 
 
 		 405 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  24.06 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  26.33 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  28.34 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.13 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  27.73 
 
 		 416 aa  125  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  25.99 
 
 		 404 aa  123  9e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  27.6 
 
 		 404 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  27.15 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  28.14 
 
 		 406 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  26.67 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  29.01 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  29.01 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  29.01 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  25.91 
 
 		 409 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  24.89 
 
 		 391 aa  120  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  26.22 
 
 		 404 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 		 403 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  26.19 
 
 		 534 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  26.43 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  25.96 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.49 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  27.89 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  25.96 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  25.96 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  26.79 
 
 		 429 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  26.79 
 
 		 429 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  25.96 
 
 		 404 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  25.96 
 
 		 404 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  26.78 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>