More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1876 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1876  aspartate aminotransferase  100 
 
 
339 aa  701    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  99.41 
 
 
415 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  99.71 
 
 
412 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  97.63 
 
 
412 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  99.71 
 
 
412 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0021  aminotransferase, classes I and II  100 
 
 
339 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  89.68 
 
 
412 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  89.94 
 
 
412 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1793  aminotransferase AlaT  89.97 
 
 
412 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  88.79 
 
 
412 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1879  aminotransferase AlaT  88.79 
 
 
412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123534  hitchhiker  0.0000142896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  87.32 
 
 
416 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6224  aminotransferase AlaT  88.79 
 
 
412 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1855  aminotransferase AlaT  88.79 
 
 
412 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  86.73 
 
 
416 aa  597  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  87.28 
 
 
415 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  74.63 
 
 
413 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  73.59 
 
 
427 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  72.57 
 
 
409 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  72.27 
 
 
413 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  73 
 
 
429 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  70.71 
 
 
409 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  72.19 
 
 
426 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  72.57 
 
 
409 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  71.09 
 
 
409 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  71.09 
 
 
414 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  71.43 
 
 
409 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  70.03 
 
 
411 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  69.64 
 
 
407 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  68.55 
 
 
418 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  69.46 
 
 
426 aa  504  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  67.75 
 
 
412 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  70.33 
 
 
435 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  70.5 
 
 
429 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  70.5 
 
 
429 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  66.86 
 
 
410 aa  497  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  69.44 
 
 
407 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  65.98 
 
 
410 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  63.88 
 
 
404 aa  475  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  66.47 
 
 
409 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  61.49 
 
 
404 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  65.07 
 
 
403 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  61.49 
 
 
377 aa  461  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  62.09 
 
 
404 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  60.6 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  64.18 
 
 
403 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  62.39 
 
 
405 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  62.39 
 
 
405 aa  454  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  62.39 
 
 
405 aa  454  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  62.39 
 
 
405 aa  454  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  62.99 
 
 
404 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  64.48 
 
 
403 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  62.99 
 
 
404 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  62.39 
 
 
405 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  62.39 
 
 
405 aa  454  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  62.99 
 
 
404 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  62.39 
 
 
405 aa  454  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  62.39 
 
 
405 aa  454  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  62.99 
 
 
404 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  62.39 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  63.28 
 
 
403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  63.28 
 
 
403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  63.28 
 
 
403 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  61.79 
 
 
404 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  61.19 
 
 
404 aa  447  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  62.99 
 
 
403 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  61.79 
 
 
405 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  62.99 
 
 
403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  62.39 
 
 
403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  60.12 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  61.19 
 
 
404 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  60.6 
 
 
404 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  60.3 
 
 
404 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  58.16 
 
 
543 aa  441  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  60 
 
 
404 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  62.69 
 
 
403 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  62.39 
 
 
403 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  60.3 
 
 
404 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  60.3 
 
 
404 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  58.51 
 
 
404 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  57.57 
 
 
546 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  58.51 
 
 
404 aa  434  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  57.57 
 
 
545 aa  435  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  58.21 
 
 
404 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  58.21 
 
 
404 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  58.46 
 
 
406 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  59.4 
 
 
404 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  58.38 
 
 
423 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0444  aminotransferase class I and II  67.71 
 
 
295 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.312987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  59.7 
 
 
403 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  57.78 
 
 
414 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  58.21 
 
 
404 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  58.21 
 
 
404 aa  426  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  57.91 
 
 
404 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  57.61 
 
 
404 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  57.61 
 
 
404 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  58.48 
 
 
404 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  58.21 
 
 
404 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  58.21 
 
 
404 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  57.01 
 
 
404 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>