More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0444 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0444  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 295 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.312987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  91.53 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  75.35 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  75.27 
 
 		 409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  73.5 
 
 		 413 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  73.24 
 
 		 426 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  73.85 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  73.5 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  73.57 
 
 		 409 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  71.48 
 
 		 414 aa  454  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  70.92 
 
 		 407 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  72.34 
 
 		 407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  70.88 
 
 		 409 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  71.73 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  70.77 
 
 		 409 aa  444  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  74.2 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  70.42 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  69.79 
 
 		 412 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  70.03 
 
 		 410 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  69.29 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  68.4 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  68.99 
 
 		 410 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  69.79 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  66.23 
 
 		 429 aa  417  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1047  aminotransferase AlaT  66.23 
 
 		 429 aa  417  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  68.17 
 
 		 416 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  68.51 
 
 		 416 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  69.1 
 
 		 415 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  67.71 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0021  aminotransferase, classes I and II  67.71 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  67.71 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  67.71 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1876  aspartate aminotransferase  67.71 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1879  aminotransferase AlaT  69.44 
 
 		 412 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123534  hitchhiker  0.0000142896 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6224  aminotransferase AlaT  69.79 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1793  aminotransferase AlaT  69.79 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1855  aminotransferase AlaT  69.79 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  68.75 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  69.44 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  66.55 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  65.84 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  65.84 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  65.84 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  65.84 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  64.41 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  64.52 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  64.52 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  64.87 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1552  aminotransferase AlaT  67.14 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  63.7 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  63.35 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  63.35 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  63.7 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  63.35 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  63.77 
 
 		 404 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  63.7 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 405 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  62.77 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  63.7 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  62.63 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 404 aa  384  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  64.08 
 
 		 410 aa  384  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  63.35 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  62.63 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  62.99 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  60.85 
 
 		 404 aa  381  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  62.28 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  60.85 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  64.06 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  61.65 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  60.99 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  60.14 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  60.85 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  61.21 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  61.57 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  64.16 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1779  aminotransferase, classes I and II  62.5 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  58.3 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3615  aminotransferase AlaT  62.5 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  58.21 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  59.79 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  63.21 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  60.87 
 
 		 405 aa  371  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  59.43 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  63.08 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  63.08 
 
 		 403 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  57.45 
 
 		 546 aa  368  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  59.43 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  62.86 
 
 		 403 aa  367  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  59.43 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  59.52 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  57.8 
 
 		 545 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  59.86 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  59.43 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>