54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4811 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4811  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
998 aa  1957    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.661642  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4158  protein of unknown function DUF214  41.02 
 
 
934 aa  535  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434869  normal  0.0912085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  31.86 
 
 
926 aa  277  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8050  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  30.57 
 
 
852 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3175  protein of unknown function DUF214  31.35 
 
 
910 aa  204  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612521  normal  0.0435773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  33.56 
 
 
881 aa  191  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0699  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
934 aa  164  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8049  hypothetical protein  31.48 
 
 
891 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0830  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
958 aa  88.2  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.800045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  24.27 
 
 
858 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.7 
 
 
857 aa  67.4  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
855 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.4 
 
 
896 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  35.53 
 
 
850 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.21 
 
 
835 aa  57.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  34.96 
 
 
851 aa  56.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  30.35 
 
 
854 aa  56.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1535  protein of unknown function DUF214  43.24 
 
 
967 aa  55.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.960064  normal  0.0795907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  29.08 
 
 
617 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.4 
 
 
856 aa  55.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.32 
 
 
841 aa  55.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  33.59 
 
 
849 aa  54.7  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
878 aa  53.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 
828 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  49.09 
 
 
849 aa  51.6  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 
897 aa  50.8  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06210  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.26 
 
 
933 aa  50.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.98 
 
 
870 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2311  hypothetical protein  25.69 
 
 
615 aa  49.7  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28.14 
 
 
841 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  29.39 
 
 
866 aa  48.5  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  26.81 
 
 
617 aa  48.1  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  27.27 
 
 
367 aa  48.1  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  21.8 
 
 
651 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.63 
 
 
863 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  20.93 
 
 
835 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 
703 aa  46.6  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28 
 
 
856 aa  46.6  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0430  hypothetical protein  21.67 
 
 
884 aa  47  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1028  hypothetical protein  35 
 
 
854 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 
855 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 
846 aa  46.2  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  32.33 
 
 
409 aa  46.2  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  27.65 
 
 
780 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 
871 aa  45.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  32.28 
 
 
868 aa  45.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.34 
 
 
821 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 
401 aa  45.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  31.54 
 
 
847 aa  45.4  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 
833 aa  45.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.54 
 
 
849 aa  45.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
861 aa  45.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  26.92 
 
 
406 aa  44.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 
452 aa  44.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>