54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4158 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4158  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 934 aa  1844    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434869  normal  0.0912085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4811  protein of unknown function DUF214  41.42 
 
 		 998 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.661642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 		 881 aa  276  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3175  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 		 910 aa  252  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612521  normal  0.0435773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  30.77 
 
 		 926 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8050  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  32.1 
 
 		 852 aa  218  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8049  hypothetical protein  30.27 
 
 		 891 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0830  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 958 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.800045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  38.94 
 
 		 849 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  38.05 
 
 		 849 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 846 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  34.26 
 
 		 851 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.89 
 
 		 880 aa  53.5  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  24.23 
 
 		 425 aa  53.5  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  29.65 
 
 		 850 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.37 
 
 		 847 aa  53.5  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.94 
 
 		 845 aa  52.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1535  protein of unknown function DUF214  38.78 
 
 		 967 aa  52.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.960064  normal  0.0795907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06210  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.75 
 
 		 933 aa  51.6  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.25 
 
 		 843 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  22.92 
 
 		 896 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 		 835 aa  50.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 		 452 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 852 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  35.65 
 
 		 408 aa  49.7  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  27.87 
 
 		 404 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 833 aa  48.5  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.48 
 
 		 854 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 897 aa  48.1  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  34.95 
 
 		 405 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  33.98 
 
 		 405 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  30.86 
 
 		 836 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.06 
 
 		 443 aa  47.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.52 
 
 		 397 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  26.39 
 
 		 408 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  31.03 
 
 		 868 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25.15 
 
 		 702 aa  46.6  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  25.98 
 
 		 424 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 		 848 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  27.62 
 
 		 408 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  33.8 
 
 		 858 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  33.8 
 
 		 873 aa  46.2  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.04 
 
 		 863 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.4 
 
 		 424 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  40.4 
 
 		 411 aa  45.8  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  27.18 
 
 		 408 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  29.92 
 
 		 402 aa  45.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.55 
 
 		 423 aa  45.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.97 
 
 		 878 aa  45.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0699  protein of unknown function DUF214  32.57 
 
 		 934 aa  45.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 		 821 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  24.79 
 
 		 436 aa  45.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  32.85 
 
 		 412 aa  45.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  30.08 
 
 		 412 aa  44.3  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>