More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4194 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4194  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 241 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100781  normal  0.264432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.49 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8764  response regulator receiver protein  55.7 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4069  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.05 
 
 		 232 aa  224  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0969233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  48.12 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.44 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  45.19 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.24 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  42.37 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  43.22 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  41.35 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.66 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.92 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.02 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.75 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 241 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 242 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 242 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  41.18 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  41.18 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.18 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.18 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  41.18 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44.58 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  41.18 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.81 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.81 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.81 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.81 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.81 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.47 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.76 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 247 aa  185  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.81 
 
 		 240 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  41.18 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  41.18 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  41.81 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.24 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.81 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.24 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.51 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  41.81 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.81 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.38 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 321 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40.51 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  40.51 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  40.51 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  40.51 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40.51 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  40.51 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  40.51 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.08 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  42.98 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.93 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.22 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  41.2 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  43.16 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>