More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ03230 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ03230  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
353 aa  724    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.244195  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10480  CobW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07990)  39.63 
 
 
409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0306416  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  33.85 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  33.5 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  27.73 
 
 
308 aa  89.7  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  34.52 
 
 
382 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  36.65 
 
 
493 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  23.77 
 
 
640 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  36.6 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  27.92 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  40.68 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  33.33 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  40.68 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  30.05 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  30.05 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  31.47 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.44 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.12 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  32.93 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  32.93 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  26.98 
 
 
624 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  33.33 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  33.33 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.52 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  32.34 
 
 
449 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  31.58 
 
 
452 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.57 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.57 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  31.61 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  26.03 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  27.39 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  32.5 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  32.17 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  32.5 
 
 
460 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  31.15 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  33.76 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  33.76 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  33.92 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.13 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  33.33 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  31.93 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  34.51 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  34.71 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.76 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  29.69 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  30.29 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.52 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  29.61 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  31.95 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  32.48 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  32.43 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  33.74 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.14 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  27.78 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  36.62 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  30.91 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  29.94 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  28.35 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  31.71 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  30.17 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  27.84 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  25.32 
 
 
614 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.11 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  34.01 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  32.17 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  35.82 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  29.83 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  33.13 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  28.74 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  31.5 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  31.25 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  32.41 
 
 
347 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  30 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  28.92 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.17 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.72 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  28.92 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  29.45 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  30.06 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  30.46 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  31.1 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  30 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  28.31 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  30.67 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  26.99 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>