288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04540 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB04540  expressed protein  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00834951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  28.19 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  30.11 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1262  ribosome recycling factor  29.63 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579547 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  28.11 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  28.42 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  28.42 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  31.03 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  34.23 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  34.55 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  28.66 
 
 		 185 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  31.45 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  29.63 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  33.52 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  33.96 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0257  ribosome recycling factor  35.6 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  35.6 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0241  ribosome recycling factor  35.6 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.331553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  35.6 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0244  ribosome recycling factor  35.6 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  31.22 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  32.85 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0463  ribosome recycling factor  32.95 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  31.21 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  29.21 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_002978  WD0529  ribosome recycling factor  28.57 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  34.39 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  32.28 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  32.28 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  31.75 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  32.28 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  31.58 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  27.51 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  32.28 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  34.39 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  29.73 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  31.44 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  34.39 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  34.39 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  30.11 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  32.45 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  32.29 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0267  ribosome recycling factor  27.89 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  32.91 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  31.87 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  29.3 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0758  ribosome recycling factor  26.94 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  27.51 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  30.53 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  32.07 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  28.95 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  26.98 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  28.33 
 
 		 185 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  31.21 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  29.94 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  28.95 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  31.58 
 
 		 185 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  30.73 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  29.07 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  31.89 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  34.18 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  32.48 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2554  ribosome recycling factor  31.25 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  30.57 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  32.98 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  28.19 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  29.84 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1384  ribosome recycling factor  32.7 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  27.42 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  29.17 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  29.3 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  30.37 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  30.89 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  30.53 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  30.19 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  32.94 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  26.92 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1494  ribosome recycling factor  31.65 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280653  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  28.11 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2973  ribosome recycling factor  30.16 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0361  ribosome recycling factor  35.66 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000245194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  30.38 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  28.57 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  29.94 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1250  ribosome recycling factor  26.16 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  32.94 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  27.68 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0341  ribosome recycling factor  33.33 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418227  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  31.05 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  30.29 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  28.03 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  29.3 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>