225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08921 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08921  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4381  LamB/YcsF family protein  38.84 
 
 		 246 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  35.1 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  35.51 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0006  LamB/YcsF family protein  38.05 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  35.51 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  33.88 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  33.88 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0008  LamB/YcsF family protein  35.47 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  35.68 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  35.95 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  35.6 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  35.2 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  34.8 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  33.47 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  35.2 
 
 		 254 aa  161  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  34 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  36.03 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  37.3 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  36.03 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  34.4 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  33.06 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  33.06 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  34.4 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  33.06 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  33.06 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  33.06 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  33.06 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  34.54 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  33.47 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  34 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  38.19 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  34.02 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  35.46 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  34.45 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  34.8 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2827  LamB/YcsF family protein  34.84 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  hitchhiker  0.00875882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  34.02 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  34.02 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  35.12 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0010  LamB/YcsF family protein  35.17 
 
 		 248 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  34.4 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  33.07 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  35.12 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  34.43 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  32.79 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  34.92 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  33.07 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  32.68 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  33.6 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  31.73 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  33.61 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  33.61 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  33.61 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  33.61 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  33.6 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1098  LamB/YcsF family protein  30.74 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.248626  normal  0.159804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  32.78 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  33.93 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  33.61 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  32.78 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  33.61 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  32.78 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0545  LamB/YcsF family protein  36.09 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  33.61 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  33.6 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2920  LamB/YcsF family protein  33.88 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  30.8 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  35.08 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  32.37 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  32.37 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  32.37 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  33.33 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  33.61 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  34.14 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1803  LamB/YcsF  32.65 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.372546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  34.14 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  34.14 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  33.2 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  34.24 
 
 		 272 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  32.26 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  33.99 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  29.76 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  31.58 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  30.56 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  32.68 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  34.06 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  34.51 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  31.2 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  31.45 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>