225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4577 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  75.81 
 
 
270 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  73.6 
 
 
266 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  73.6 
 
 
266 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  73.6 
 
 
266 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  73.2 
 
 
266 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  73.2 
 
 
266 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  73.2 
 
 
266 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  73.2 
 
 
266 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  71.66 
 
 
252 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  72.47 
 
 
252 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  67.19 
 
 
275 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6280  hypothetical protein  73.09 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0369  hypothetical protein  73.09 
 
 
260 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.244738  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2951  hypothetical protein  71.89 
 
 
260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  69.23 
 
 
252 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  67.07 
 
 
252 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  66.67 
 
 
252 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  66.67 
 
 
252 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  67.35 
 
 
251 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  65.18 
 
 
251 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2385  hypothetical protein  62.95 
 
 
264 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  62.25 
 
 
260 aa  324  8.000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  59.53 
 
 
272 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3259  hypothetical protein  59.07 
 
 
259 aa  322  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.190994 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  55.69 
 
 
258 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  45.24 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 
255 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  44 
 
 
254 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
254 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 
252 aa  205  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  39.76 
 
 
255 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  39.76 
 
 
255 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  39.37 
 
 
255 aa  201  9e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 
304 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
253 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  43.41 
 
 
258 aa  198  9e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 
250 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  45.71 
 
 
301 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
254 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 
250 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 
254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  40.5 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  43.14 
 
 
274 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  47.26 
 
 
255 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  42.4 
 
 
254 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  38.4 
 
 
253 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  38 
 
 
254 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
255 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  42.69 
 
 
256 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 
251 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  41.5 
 
 
257 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  44.02 
 
 
256 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 
254 aa  191  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  40.55 
 
 
253 aa  191  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
255 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 
254 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 
250 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  37.6 
 
 
253 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  37.2 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  37.2 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  37.6 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  41.34 
 
 
254 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  41.27 
 
 
255 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
256 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  38.82 
 
 
255 aa  188  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  37.2 
 
 
253 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  37.2 
 
 
253 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  38.58 
 
 
252 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  36.69 
 
 
253 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 
270 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.49 
 
 
255 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 
252 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 
299 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 
252 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42.17 
 
 
255 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  40.39 
 
 
273 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  40 
 
 
251 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  44.05 
 
 
256 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  41.09 
 
 
256 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 
256 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.98 
 
 
253 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  38.71 
 
 
254 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  44.71 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  42.02 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  36.51 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  39.44 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  43.39 
 
 
252 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  42.34 
 
 
250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 
253 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 
255 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  40.78 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 
255 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  44.17 
 
 
252 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4552  LamB/YcsF family protein  43.75 
 
 
255 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 
251 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  43.33 
 
 
260 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>