225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4381 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4381  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0010  LamB/YcsF family protein  50.21 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0006  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0021  hypothetical protein  49.36 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  42.45 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  44.08 
 
 		 247 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  42.51 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  43.67 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  42.62 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  43.62 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0008  LamB/YcsF family protein  44.54 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  44.67 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  43.85 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  43.85 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  44.67 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  43.03 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  42.04 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  43.44 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  40.57 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  41.3 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  41.8 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  41.74 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  42.08 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  40.74 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1098  LamB/YcsF family protein  41.32 
 
 		 253 aa  187  9e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.248626  normal  0.159804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2827  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  hitchhiker  0.00875882 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  38.78 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  38.87 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08921  hypothetical protein  38.84 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  38.37 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  40.57 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  38.78 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  42.74 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  41.53 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  41.8 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2920  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  38.55 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  38.55 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  38.87 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  39.36 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1803  LamB/YcsF  42.28 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.372546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  42.04 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  38.71 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  41.15 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  41.06 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  39.11 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  36.84 
 
 		 251 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  38.96 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  34.82 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  40.73 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  40.76 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  39.76 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3108  LamB/YcsF family protein  38.37 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  38.21 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  38.46 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>