225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29760 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  100 
 
 		 255 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  53.85 
 
 		 252 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  53.78 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  55.56 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  52.63 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  52.94 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 256 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  50.61 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  52.23 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  54.88 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 		 255 aa  234  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  54.37 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  50.61 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  54.29 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  52.65 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  53.44 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  52.44 
 
 		 251 aa  224  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.82 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.82 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  50.61 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  50.41 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  52.63 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  51.42 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  48.16 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  39.75 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  43.85 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  47.15 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  47.33 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  47.13 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  45.42 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  47.33 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  48.16 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  44.58 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  39.44 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  46.5 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  45.71 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  44.76 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  39.13 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  38.74 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  44.98 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  47.08 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  47.76 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  41.3 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  39.13 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  38.74 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  38.74 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  42.11 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  46.94 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  44.07 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  42.39 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  41.56 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  44.63 
 
 		 254 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  38.34 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  37.94 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  38.74 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>