More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3334 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3334  inner-membrane translocator  100 
 
 
388 aa  758    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  37.85 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.46 
 
 
418 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.67 
 
 
418 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.37 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.37 
 
 
418 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.27 
 
 
421 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.07 
 
 
418 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 
421 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  32.78 
 
 
407 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.67 
 
 
418 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 
339 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  32.92 
 
 
443 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.74 
 
 
423 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.6 
 
 
325 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
407 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3870  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.27 
 
 
425 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  34.19 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  32.91 
 
 
358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.22 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  33.87 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.68 
 
 
417 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  30.32 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.01 
 
 
389 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  32.87 
 
 
318 aa  146  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.14 
 
 
424 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0106  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.59 
 
 
424 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.71 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.71 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.71 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
415 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
358 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.71 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  32.27 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  31.75 
 
 
321 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0230  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.79 
 
 
427 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.733178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.53 
 
 
423 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  34.94 
 
 
407 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  30.13 
 
 
433 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 
389 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.02 
 
 
417 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.71 
 
 
428 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4057  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.65 
 
 
424 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.71 
 
 
428 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  31.95 
 
 
389 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  32.19 
 
 
389 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.02 
 
 
412 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.49 
 
 
389 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0259  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
425 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.46 
 
 
307 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
318 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  31.31 
 
 
389 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  31.31 
 
 
389 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  31.31 
 
 
389 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3933  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.26 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3874  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.26 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212137  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3764  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.37 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3831  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.37 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3753  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.26 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  30.99 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.640625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03305  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  35.17 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  31.13 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.27 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3866  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.17 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3654  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.17 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0260  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.17 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4773  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.17 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3738  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.17 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03258  hypothetical protein  35.17 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  31.86 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3935  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.17 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  32.5 
 
 
435 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
389 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
322 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3859  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.91 
 
 
425 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.107872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  31.96 
 
 
399 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.56 
 
 
427 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.56 
 
 
427 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  34.12 
 
 
358 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.56 
 
 
423 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  31.01 
 
 
398 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  30.6 
 
 
297 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  32.78 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.26 
 
 
463 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  30.89 
 
 
385 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  30.74 
 
 
327 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4657  inner-membrane translocator  31.25 
 
 
433 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123215  decreased coverage  0.00142103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  33.46 
 
 
282 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  29.17 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  29.8 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  31.13 
 
 
463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0760  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000323795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1872  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  0.0232173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4921  inner-membrane translocator  32.81 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0573712  decreased coverage  0.000000000000182248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
293 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  32.38 
 
 
372 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>