89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0110 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0110  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1890  hypothetical protein  47.46 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4849  hypothetical protein  42.36 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4761  hypothetical protein  46.22 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5420  membrane protein-like protein  47.46 
 
 		 133 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24885  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5442  membrane protein-like  47.46 
 
 		 133 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  35.92 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2199  hypothetical protein  38.79 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  35.21 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  30.71 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  29.29 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0232  hypothetical protein  49.15 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  33.78 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  35 
 
 		 177 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  34.25 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  30.07 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  31.69 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  30.99 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  30.07 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  30.99 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  30.99 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  31.08 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  28.37 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  30.94 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  29.79 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  30.94 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  25.71 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  29.5 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  27.7 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  29.5 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  27.03 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  29.37 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  32.03 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  27.74 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  34.26 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  34.26 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2017  hypothetical protein  32.87 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  29.29 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  32.17 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  29.37 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  26.95 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  31.75 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  27.34 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  30.94 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  31.2 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  28.33 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  27.08 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  25.34 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  26.89 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  28.78 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  28.06 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  23.97 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5018  hypothetical protein  29.79 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0850066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  29.79 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  29.45 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  30.94 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  29.79 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  28.99 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  32.48 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  28.99 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  27.96 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1839  hypothetical protein  32.12 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  28.37 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  31.15 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  25.87 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  28.17 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  31.15 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  28.67 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  25.81 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  34.15 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  23.19 
 
 		 149 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  26.03 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0413  hypothetical protein  22.38 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181142  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  27.08 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  27.08 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  27.08 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  27.08 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>