100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1890 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  279  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0110  hypothetical protein  45.32 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4849  hypothetical protein  44.68 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5442  membrane protein-like  43.26 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5420  membrane protein-like protein  43.26 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24885  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4761  hypothetical protein  45.22 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  33.57 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2199  hypothetical protein  40.17 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  32.14 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  32.14 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  32.86 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0232  hypothetical protein  43.97 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  33.79 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  31.47 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  34.27 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  31.47 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  31.47 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  34.27 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  34.04 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  30.5 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  34.04 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  33.57 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  30.07 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  33.79 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  32.39 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  29.5 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  34.48 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2017  hypothetical protein  35.65 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  30.58 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  30.99 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  29.08 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  34.03 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  29.58 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  29.58 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  29.58 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  28.28 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  32.62 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  27.89 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  30.69 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  29.7 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  31.94 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  33.1 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  28.76 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  32.14 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  30.15 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  30.28 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  29.7 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  32.39 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  33.04 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  31.94 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  29.23 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  27.66 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  32.39 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  28.47 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  32.69 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  29.37 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  25.35 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  28.06 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  26.53 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  30.28 
 
 		 140 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  30.28 
 
 		 140 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  33.65 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  27.03 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  28.67 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  28.47 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  23.08 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  31.68 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  32.87 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  27.14 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  31.68 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  28.17 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  30.39 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  29.17 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  28 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  28.87 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  29.58 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  22.92 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  24.11 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3667  hypothetical protein  34.78 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290827  normal  0.787143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1839  hypothetical protein  34.06 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  24.67 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3100  hypothetical protein  35.87 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3827  hypothetical protein  35.48 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78759  normal  0.497757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  28.08 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03675  hypothetical protein  29.13 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>