89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1839 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  284  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  48.67 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  44.14 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  41.96 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  39.71 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  39.86 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  40.58 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  38.52 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  38.52 
 
 		 177 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  40.31 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  39.53 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  36.76 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  38.13 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  34.56 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  36.3 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  38.85 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  34.07 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  34.56 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  36.3 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  35.56 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  36.3 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  36.3 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  38.85 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  38.85 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  34.81 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  36.23 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  35.56 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  35.38 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  33.09 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  37.68 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  33.57 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  37.41 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  34.56 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  32.59 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  28.36 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  36.3 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  31.62 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  27.41 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  35.56 
 
 		 180 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  27.94 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  32.46 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5018  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0850066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  30.7 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  26.87 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  34.23 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0110  hypothetical protein  32.12 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  34.86 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  35.56 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  27.03 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  28.89 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  30.63 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  30.63 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  33.94 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  35.29 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  28.78 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  29.41 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1890  hypothetical protein  37.38 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  26.9 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  26.47 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  27.59 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  28.68 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  29.5 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  27.59 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  25.18 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  27.94 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  34.78 
 
 		 140 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  29.45 
 
 		 175 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  32.97 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  26.35 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  24.82 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  22.92 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  28.37 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  24.44 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  25.66 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  24.44 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>