39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2312 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2312  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  330  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0562  hypothetical protein  53.66 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3847  hypothetical protein  43.23 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0158  hypothetical protein  39.35 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3100  hypothetical protein  31.41 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3827  hypothetical protein  31.41 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78759  normal  0.497757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3667  hypothetical protein  29.93 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290827  normal  0.787143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  25.36 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11150  hypothetical protein  33.09 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  30.19 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2264  hypothetical protein  34.68 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124319  normal  0.0478819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  27.66 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  23.57 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  28.78 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01473  predicted membrane protein i A1501  30.16 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  31.21 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  31.21 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  31.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  29.71 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  28.32 
 
 		 142 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  29.08 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  26.06 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  30.5 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  26.95 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  24.29 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  24.77 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  30.28 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  32.14 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  23.57 
 
 		 141 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  28.7 
 
 		 140 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  29.79 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  29.29 
 
 		 139 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  29.79 
 
 		 140 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  27.03 
 
 		 144 aa  42  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  24.5 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  28.06 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  26.61 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  23.57 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>