50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2017 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2017  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  251  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5420  membrane protein-like protein  37.5 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24885  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5442  membrane protein-like  37.5 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4849  hypothetical protein  35.42 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829125  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0110  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2199  hypothetical protein  36.46 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1890  hypothetical protein  35.65 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4761  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360388  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  32.87 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  26.62 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  29.29 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0232  hypothetical protein  34.38 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  29.29 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  29.29 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  28.17 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  31.91 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  29.29 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  28.17 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  36.08 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  30.99 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  28.06 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  31.53 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  24.46 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  26.43 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  29.71 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  25.18 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  30.63 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  31.46 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  27.46 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  30.28 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  35.64 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  31.87 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  30.6 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  28.3 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  28.17 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  27.86 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  25.71 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  28.85 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  24.64 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  24.11 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  27.88 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  26.06 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  25.35 
 
 
146 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  23.02 
 
 
146 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  33.94 
 
 
142 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  29.17 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>