39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4761 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4761  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4849  hypothetical protein  79.7 
 
 		 133 aa  206  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5442  membrane protein-like  78.2 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5420  membrane protein-like protein  78.2 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24885  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0232  hypothetical protein  88.72 
 
 		 133 aa  183  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2199  hypothetical protein  66.09 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0110  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1890  hypothetical protein  45.22 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2017  hypothetical protein  31.25 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  29.71 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  33.62 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  29.79 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  26.39 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  29.86 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  27.52 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  27.52 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  31.72 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  28.7 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  27.66 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  26.95 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  28.83 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  27.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  27.86 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  28.37 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  26.36 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  26.76 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  27.08 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  27.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  25.69 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  27.08 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  27.12 
 
 		 179 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  26.39 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  28.48 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  25 
 
 		 146 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>