51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0232 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0232  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  247  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4849  hypothetical protein  84.21 
 
 
133 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829125  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5420  membrane protein-like protein  82.71 
 
 
133 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24885  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5442  membrane protein-like  82.71 
 
 
133 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4761  hypothetical protein  88.72 
 
 
133 aa  193  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360388  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2199  hypothetical protein  64.35 
 
 
133 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0110  hypothetical protein  46.53 
 
 
145 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1890  hypothetical protein  43.97 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2017  hypothetical protein  34.38 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  31.21 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  34.04 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  32.62 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  32.87 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  32.43 
 
 
178 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  31.43 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  34.13 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  29.36 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  29.36 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  30.56 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  28.97 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  27.66 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  31.69 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  33.79 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  30.99 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  29.63 
 
 
146 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  30.99 
 
 
178 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  31.03 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  29.66 
 
 
179 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  30.34 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  29.17 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  30.36 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  27.78 
 
 
141 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  31.47 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  29.17 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  28.18 
 
 
148 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  29.86 
 
 
141 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  28.77 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  27.46 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  30.82 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  24.78 
 
 
180 aa  43.5  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  28.44 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  29.36 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  26.79 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  26.79 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  24.44 
 
 
197 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  28.77 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>