93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4908 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4908  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2802  hypothetical protein  45.87 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3512  hypothetical protein  43.58 
 
 		 223 aa  184  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0582986  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1205  hypothetical protein  40.72 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1616  iron-sulfur cluster-binding protein  44.34 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3274  iron-sulfur cluster-binding protein  40.38 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  39.07 
 
 		 588 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  38.6 
 
 		 599 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.6 
 
 		 562 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1070  AIG2 family protein  32.77 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  31.45 
 
 		 283 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  25.15 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  26.01 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  33.33 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0202  peptidase M24A  26.89 
 
 		 261 aa  48.5  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  27.68 
 
 		 356 aa  47.8  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3901  methionine aminopeptidase, type I  32.04 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  27.73 
 
 		 259 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  29.13 
 
 		 409 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  25.97 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  27.04 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  23.89 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  35.05 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  27.39 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  29.17 
 
 		 346 aa  45.4  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  33.33 
 
 		 273 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  33.33 
 
 		 249 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  30.17 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  24.86 
 
 		 287 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  25.47 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26 
 
 		 353 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  31.78 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  25.2 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  25 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  24.56 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  26.09 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  23.53 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  28.57 
 
 		 357 aa  44.3  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  24.28 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  28.57 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  32.26 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  29.73 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  25.47 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  22.94 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  32.74 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  23.9 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  31.25 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  26.75 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  23.12 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.39 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  24.4 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  26.73 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  31.33 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  28.1 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  33.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  30.39 
 
 		 277 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  33.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  33.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  24.74 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26 
 
 		 353 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  28.57 
 
 		 405 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  30.77 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  30.19 
 
 		 274 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.56 
 
 		 356 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  25.93 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  25.93 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  22.53 
 
 		 261 aa  42  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.39 
 
 		 356 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  27.49 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  23.62 
 
 		 356 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  25.79 
 
 		 253 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3684  methionine aminopeptidase, type I  26.45 
 
 		 270 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0454054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  25.79 
 
 		 253 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  24 
 
 		 353 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  23.9 
 
 		 279 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  28.18 
 
 		 360 aa  42  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  22.16 
 
 		 251 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  26.5 
 
 		 405 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  29.92 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  26.05 
 
 		 265 aa  41.6  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000857488  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23580  methionine aminopeptidase, type I  28.78 
 
 		 282 aa  41.6  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  25.71 
 
 		 275 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4293  methionine aminopeptidase, type I  27.72 
 
 		 281 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  32.94 
 
 		 257 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2580  methionine aminopeptidase  26.04 
 
 		 290 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>