More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0635 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
254 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  69.17 
 
 
253 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  69.96 
 
 
254 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  67.98 
 
 
254 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  66.54 
 
 
254 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  66.14 
 
 
254 aa  361  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  65.22 
 
 
253 aa  359  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  48.79 
 
 
248 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  48.39 
 
 
248 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  48.79 
 
 
250 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  44.94 
 
 
248 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  37.6 
 
 
248 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  40.49 
 
 
249 aa  204  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  41.7 
 
 
247 aa  204  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  42.17 
 
 
247 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  40.32 
 
 
252 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  40.32 
 
 
252 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  39.11 
 
 
251 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  40.08 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  38.87 
 
 
250 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  38.46 
 
 
250 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  37.6 
 
 
250 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  38.06 
 
 
250 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  37.05 
 
 
252 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  37.65 
 
 
249 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  37.65 
 
 
252 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  38.06 
 
 
249 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  38.46 
 
 
249 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  36.89 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  37.25 
 
 
253 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  36.61 
 
 
279 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  36.61 
 
 
279 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  35.97 
 
 
268 aa  165  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  37.4 
 
 
256 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  35.43 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  35.92 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  35.63 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  36.21 
 
 
256 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  35.43 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  36.14 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  35.43 
 
 
279 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  34.65 
 
 
256 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  33.73 
 
 
247 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  35.48 
 
 
275 aa  161  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  34.65 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  34.01 
 
 
247 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  35.04 
 
 
279 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  35.89 
 
 
264 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
287 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  35.77 
 
 
250 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  34.82 
 
 
250 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  34.82 
 
 
250 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  34.94 
 
 
251 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  35.18 
 
 
287 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  35.48 
 
 
264 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  35.1 
 
 
251 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0975  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 
250 aa  158  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  34.16 
 
 
248 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  34.84 
 
 
250 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  35.1 
 
 
251 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  32.37 
 
 
248 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  32.37 
 
 
248 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  32.37 
 
 
248 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  32.37 
 
 
248 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  35.46 
 
 
274 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  32.37 
 
 
248 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  35.74 
 
 
249 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  35.27 
 
 
269 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  32.79 
 
 
281 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  32.49 
 
 
236 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  32.37 
 
 
248 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  32.49 
 
 
236 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  32.49 
 
 
236 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  34.82 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  33.2 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  34.82 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 
250 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  31.95 
 
 
248 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  33.87 
 
 
277 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  32.68 
 
 
279 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  36.48 
 
 
259 aa  155  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  36.95 
 
 
266 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  34.82 
 
 
248 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  35.43 
 
 
281 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  34.25 
 
 
255 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  36 
 
 
262 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  34.94 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  34.94 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0054  methionine aminopeptidase  35.2 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  37.24 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>