More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5698 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
254 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  77.17 
 
 
254 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  73.91 
 
 
253 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  70.87 
 
 
254 aa  387  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  64.82 
 
 
254 aa  363  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  66.14 
 
 
254 aa  361  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  63.39 
 
 
253 aa  353  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  45.75 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  46.03 
 
 
250 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
248 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  47.6 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  44.53 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  46.4 
 
 
248 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  43.95 
 
 
247 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  39.68 
 
 
250 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  39.27 
 
 
249 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  39.27 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  39.04 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  37.1 
 
 
248 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  38.06 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  38.87 
 
 
250 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  39.29 
 
 
252 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  39.29 
 
 
252 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  39.27 
 
 
252 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  39.27 
 
 
249 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  38.49 
 
 
251 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  39.27 
 
 
247 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  36.44 
 
 
249 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  38.46 
 
 
249 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  36.03 
 
 
249 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  36.84 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  37.3 
 
 
256 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
279 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
279 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  35.08 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  35.48 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  34.27 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  36.13 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  35.39 
 
 
250 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  35.2 
 
 
253 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  35.2 
 
 
253 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0935  methionine aminopeptidase, type I  34.52 
 
 
265 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.976689  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
279 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  36.22 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  33.87 
 
 
281 aa  161  9e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  36.29 
 
 
253 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  34.82 
 
 
250 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  36.33 
 
 
274 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  35.29 
 
 
248 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  32.68 
 
 
255 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  35.54 
 
 
248 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 
268 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  35.08 
 
 
303 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  34.85 
 
 
255 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  36.71 
 
 
253 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  33.2 
 
 
275 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  34.6 
 
 
250 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  33.61 
 
 
256 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  34.51 
 
 
256 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  35.48 
 
 
249 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  34 
 
 
276 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  33.06 
 
 
274 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  35.22 
 
 
247 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  32.67 
 
 
262 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  35.08 
 
 
249 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  35.32 
 
 
259 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  36.03 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  34.15 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  35.22 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  35.37 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  35.34 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  33.33 
 
 
265 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  33.6 
 
 
287 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 
285 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  31.62 
 
 
277 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  34.96 
 
 
251 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  34.52 
 
 
258 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  34.45 
 
 
248 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  34.27 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  35.12 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  34.27 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  34.27 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>