More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1965 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  71.94 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  71.65 
 
 
254 aa  391  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  70.87 
 
 
254 aa  387  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  69.96 
 
 
254 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  69.57 
 
 
253 aa  374  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  65.75 
 
 
253 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 
248 aa  228  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  47.81 
 
 
248 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  47.62 
 
 
250 aa  225  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  47.41 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
248 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  47.01 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  44.53 
 
 
250 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  39.76 
 
 
248 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  43.72 
 
 
250 aa  204  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  41.7 
 
 
250 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  40.8 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  40.8 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  40.08 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  42.11 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  42.63 
 
 
252 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  41.3 
 
 
249 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  42.51 
 
 
250 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  41.7 
 
 
252 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  39.04 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  42.17 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  41.7 
 
 
249 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  40.56 
 
 
249 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  40.08 
 
 
249 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  36.84 
 
 
279 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  36.84 
 
 
279 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  36.44 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  37.35 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  36.03 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  34.25 
 
 
268 aa  164  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  34.01 
 
 
279 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  34.82 
 
 
280 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  35.37 
 
 
250 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  36.93 
 
 
259 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  36.59 
 
 
258 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  35.57 
 
 
261 aa  159  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
248 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
248 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
248 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
248 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
236 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  33.6 
 
 
279 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
248 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
236 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  34.41 
 
 
279 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
236 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
248 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  34.71 
 
 
248 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
248 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  34.29 
 
 
256 aa  158  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  32.93 
 
 
251 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  34.41 
 
 
250 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  34.01 
 
 
285 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  34.41 
 
 
250 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  34.27 
 
 
275 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  33.87 
 
 
277 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  36.14 
 
 
259 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  32.93 
 
 
250 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  34.01 
 
 
303 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  34.03 
 
 
248 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  32.66 
 
 
251 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  33.6 
 
 
281 aa  155  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  33.73 
 
 
248 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  34.85 
 
 
250 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  38.12 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  33.46 
 
 
262 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  34.41 
 
 
256 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  32.79 
 
 
247 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  34.68 
 
 
249 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  34.82 
 
 
256 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  32.66 
 
 
251 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  32.13 
 
 
248 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  31.6 
 
 
249 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  33.99 
 
 
287 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  32.27 
 
 
254 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0562  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 
263 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 
276 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  32.4 
 
 
249 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  33.61 
 
 
248 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  33.9 
 
 
249 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  34.27 
 
 
287 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  33.2 
 
 
275 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  32.14 
 
 
269 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  34.58 
 
 
255 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  34.65 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  34.8 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  32.03 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>