More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2133 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
259 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  56.76 
 
 
257 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  55.47 
 
 
248 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  59.11 
 
 
248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  58.17 
 
 
256 aa  285  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  54.25 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  57.43 
 
 
251 aa  280  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  54.98 
 
 
259 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  56.4 
 
 
251 aa  279  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  56 
 
 
251 aa  279  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  55.65 
 
 
248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  52.23 
 
 
250 aa  270  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  52.63 
 
 
250 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  51.82 
 
 
249 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
248 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
248 aa  265  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  54.25 
 
 
248 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  52.19 
 
 
251 aa  264  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
247 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
249 aa  261  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  47.77 
 
 
257 aa  261  8e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
255 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  50.61 
 
 
248 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
248 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 
281 aa  257  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
248 aa  256  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  50.58 
 
 
258 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
259 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  51.01 
 
 
265 aa  256  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
249 aa  254  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
249 aa  254  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  50.64 
 
 
236 aa  254  9e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  50.64 
 
 
236 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  50.64 
 
 
236 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
249 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  52.33 
 
 
259 aa  249  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 
272 aa  249  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  52.34 
 
 
274 aa  248  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 
251 aa  248  7e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  52.76 
 
 
273 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
258 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  46.99 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  49.8 
 
 
272 aa  244  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  47.37 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  46.8 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  46.37 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  47.83 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  47.06 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  51.06 
 
 
236 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  50.63 
 
 
261 aa  241  7e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  50.21 
 
 
236 aa  241  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  47.56 
 
 
262 aa  241  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  48 
 
 
270 aa  241  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  51.49 
 
 
236 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  46.46 
 
 
255 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  45.75 
 
 
249 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
250 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  46.8 
 
 
264 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  50.61 
 
 
248 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 
274 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  47.95 
 
 
263 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  51.38 
 
 
269 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  47.39 
 
 
272 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  48.94 
 
 
236 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  47.64 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  44.94 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  47.58 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  43.72 
 
 
249 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 
264 aa  232  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
286 aa  231  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  48.61 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  45.78 
 
 
250 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
271 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1447  methionine aminopeptidase  42.11 
 
 
248 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1489  methionine aminopeptidase  42.51 
 
 
252 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12113  methionine aminopeptidase, type I  45.56 
 
 
277 aa  229  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0855577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  47.2 
 
 
255 aa  228  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  46.4 
 
 
250 aa  228  8e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  46.4 
 
 
250 aa  228  8e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  46.53 
 
 
251 aa  228  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3721  methionine aminopeptidase  42.51 
 
 
248 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1474  methionine aminopeptidase  41.7 
 
 
248 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.724468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  46.49 
 
 
277 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1590  methionine aminopeptidase  41.7 
 
 
248 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1623  methionine aminopeptidase  41.7 
 
 
248 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
253 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
277 aa  225  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>