More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1086 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  92.4 
 
 
250 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  61.04 
 
 
249 aa  334  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  59.3 
 
 
258 aa  301  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 
250 aa  294  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  57.77 
 
 
259 aa  292  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  54.88 
 
 
248 aa  287  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  58.33 
 
 
258 aa  284  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  53.25 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  52.85 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  52.85 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  52.85 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  52.85 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  52.85 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  52.85 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  52.85 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  57.03 
 
 
261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 
248 aa  281  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  55.73 
 
 
258 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  53.6 
 
 
258 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  56.2 
 
 
255 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  54.03 
 
 
249 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  54.03 
 
 
249 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  56.15 
 
 
248 aa  279  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  56.28 
 
 
248 aa  278  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  54.8 
 
 
260 aa  278  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  54.47 
 
 
236 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  54.47 
 
 
236 aa  278  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  54.47 
 
 
236 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  56.56 
 
 
248 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  52.61 
 
 
251 aa  276  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  53.01 
 
 
251 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  55.2 
 
 
258 aa  274  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  52.21 
 
 
251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  56.75 
 
 
259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  56.75 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  56.45 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 
263 aa  272  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  56.25 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  53.66 
 
 
249 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  54 
 
 
261 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  53.31 
 
 
249 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  52.63 
 
 
259 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  54 
 
 
261 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  52.8 
 
 
256 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  53.25 
 
 
249 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  51.63 
 
 
248 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  53.6 
 
 
260 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 
255 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
257 aa  266  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
248 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  51.2 
 
 
260 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
260 aa  265  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  50.8 
 
 
260 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
249 aa  264  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  51.49 
 
 
236 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  50.8 
 
 
260 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
247 aa  263  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  52.63 
 
 
248 aa  263  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  50.8 
 
 
260 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  54.84 
 
 
274 aa  262  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  52.94 
 
 
267 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
251 aa  262  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  49.39 
 
 
271 aa  261  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 
265 aa  261  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  53.6 
 
 
261 aa  261  8e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 
260 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  50.8 
 
 
260 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
254 aa  260  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  51.57 
 
 
256 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 
263 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  51.82 
 
 
248 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  53.41 
 
 
284 aa  259  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  51.82 
 
 
277 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  50.78 
 
 
272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  52.57 
 
 
254 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  51.79 
 
 
258 aa  258  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  51.79 
 
 
270 aa  258  9e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
261 aa  257  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
274 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  51.81 
 
 
253 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  51.95 
 
 
274 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  51.81 
 
 
253 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  52.82 
 
 
273 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  52.77 
 
 
236 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  44.98 
 
 
259 aa  256  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
276 aa  255  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
274 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  51.84 
 
 
274 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
249 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  52.82 
 
 
255 aa  255  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
250 aa  255  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
266 aa  255  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  52.94 
 
 
267 aa  255  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  50 
 
 
253 aa  254  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  54.58 
 
 
268 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
274 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  50.98 
 
 
269 aa  254  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>