More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1552 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  65.59 
 
 		 249 aa  345  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  66.13 
 
 		 250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  64.37 
 
 		 252 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  63.97 
 
 		 252 aa  341  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  65.99 
 
 		 250 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  65.59 
 
 		 250 aa  338  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  63.56 
 
 		 250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  64.37 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  61.94 
 
 		 249 aa  321  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  63.56 
 
 		 249 aa  321  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  61.54 
 
 		 249 aa  315  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  53.25 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  48.99 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 250 aa  248  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  48.58 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  48.18 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  47.79 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  43.2 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  43.2 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  42 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  44.94 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  43.32 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  40.32 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  43.32 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  42.57 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  45.16 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  37.8 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  38.34 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  39.52 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  39.92 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  40.39 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  38.58 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  38.31 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  37.15 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  39.59 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  38.31 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  39.52 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  38.34 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  37.25 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  36.36 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  42.26 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  40.41 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  37.25 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  34.65 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  36.76 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  38.37 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  38.34 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  38.15 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  37.1 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  36 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  39.3 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  37.55 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  37.65 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  37.75 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  38.1 
 
 		 259 aa  181  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  37.75 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  37.55 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  37.55 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  36.59 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  38.71 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  35.97 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  38.15 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  37.7 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  38.1 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  35.48 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  38.15 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  34.88 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  38.1 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  38.58 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  37.55 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  35.97 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2321  methionine aminopeptidase, type I  36.95 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  38.15 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  37.1 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>