More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3313 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  73.28 
 
 		 252 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  73.68 
 
 		 252 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  68.42 
 
 		 249 aa  367  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  64.37 
 
 		 250 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  63.97 
 
 		 250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  63.97 
 
 		 250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  63.56 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  62.75 
 
 		 250 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  61.94 
 
 		 248 aa  321  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  59.51 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  58.7 
 
 		 249 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  47.39 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  47.39 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  46.99 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  45.6 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  45.6 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  44.72 
 
 		 248 aa  225  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  42.74 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  41.3 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  41.3 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  41.3 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  38.46 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  38.06 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  41.3 
 
 		 247 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  40.56 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  38.46 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  37.2 
 
 		 261 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  35.22 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1550  methionine aminopeptidase  38.19 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  37.75 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  38.55 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  38.15 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  38.55 
 
 		 263 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  38.55 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  38.96 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  35.74 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  34.8 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  34.15 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  34.39 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  34.39 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  34.39 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  32.66 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  34.15 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  35.86 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  33.99 
 
 		 265 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  36.33 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  34.69 
 
 		 285 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  35.1 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  38 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  35.37 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  37.75 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  34.82 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  37.35 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  37.6 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  33.46 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  33.33 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  33.46 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  32.94 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  33.6 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  35.51 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  34.96 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  33.86 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  32.55 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  33.99 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  32.55 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  34.92 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0526  methionine aminopeptidase  35.06 
 
 		 264 aa  158  6e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  34.38 
 
 		 258 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  33.76 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  33.76 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>