More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1254 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  98.8 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  92.8 
 
 		 250 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  81.85 
 
 		 250 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  74.19 
 
 		 249 aa  380  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  71.49 
 
 		 249 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  70.56 
 
 		 252 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  69.76 
 
 		 252 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  65.86 
 
 		 249 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  66.27 
 
 		 249 aa  341  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  65.59 
 
 		 248 aa  338  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  63.97 
 
 		 249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  52.23 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  51.82 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  51.82 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  51.82 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  44.94 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  43.72 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  43.72 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  45.75 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  42.74 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  43.72 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  40.49 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  40.49 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  39.68 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  39.27 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  38.87 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  38.06 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  36.99 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  42.11 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  36.73 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  40.49 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  38.82 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  36.17 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  36.17 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  36.17 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  36.14 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  37.8 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  35.77 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  34.84 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  35.83 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  31.58 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  33.99 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  35.94 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  36.59 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  37.4 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  33.85 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  31.23 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  33.89 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  34.01 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  34.01 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  34.15 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  35 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  34.16 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  33.73 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  33.6 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10020  methionine aminopeptidase, type I  36.18 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  33.6 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  33.87 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  33.73 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  30.65 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  30.65 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  33.74 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  33.06 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1500  methionine aminopeptidase, type I  34.01 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  32.93 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  32.66 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  30.36 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  33.99 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  30.36 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  32.94 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  34.54 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2125  methionine aminopeptidase, type I  36.18 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  32.11 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  32.66 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>